儿童青少年科负责治疗新生儿在内的18周岁以下的儿童青少年的各种疾病。

专业治疗免疫缺损疾病和风湿性疾病的儿童青少年科是除了首尔地区之外大田圣母医院是唯一的一家。儿童青少年科不仅被评为具备了川崎病的全新治疗方针，还在可以引起严重肺炎的支原体病感染的研究和治疗上在国内处于领先地位。